新冠病毒Omicron加速变异,新变异株或引发人群重复感染-动态焦点
发布时间:2023-01-12 20:10:56 文章来源:达瑞生物官微
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自2021年底新冠病毒Omicron出现以来,该变异株在全球掀起多轮疫情,持续向加强免疫逃逸的方向进化。全球多国主要流行株已被BQ.1和XBB家族替代,美国新增的COVID-19病例中约80%由BQ.1、BQ.1.1或XBB这三种Omicron新亚型引起的[1]。而在新加坡、孟加拉国和印度在内的亚洲国家,Omicron新亚型XBB正在掀起了新的感染浪潮。而中国目前流行的仍以奥密克戎BA.5亚分支BA.5.2和BF.7(BA.5.2.1.7的缩写)为主。


(资料图)

图1 美国CDC公布的BQ.1.1、BQ.1、XBB、BA.5、BF.7、BN.1变异株的流行情况[1]

新冠病毒Omicron新型变异株的进化路径

据美国密苏里大学微生物学Marc Johnson教授早前公开的Omicron变异株的进化路径图(如图2)详细的阐述了当前主要新型变异株的进化史[2]。BA.5与BA.4有着相同的S蛋白突变位点,在获得R346T突变后,演变为变异株BA.4.6,而BA.5的子突变体BA.5.2(与BA.5株的S蛋白突变位点相同)突变R346T、K444T位点后,产生变异株BF.7。BA.4.6和BF.7在BA.4/5基础上均增加了受体结合域RBD突变R346T,这可以进一步逃逸BA.5感染诱导的中和抗体,这被北京大学谢晓亮团队9月份发表的文章中BA.4.6数据所证实[3]。从美国CDC公布的变异株流行情况来看,BA.5和BA.4.6变异株是10月份之前的主要流行株,后逐渐被BF.7、BQ.1、BQ.1.1以及XBB株取代。

图2 Omicron变异株的进化路径图

BQ.1是奥密克戎BA.5变异产生的第六代亚分支,相比较BA.5,BQ.1在RBD区域获得了K444T和N460K突变,而BQ.1.1是BQ.1的第一代亚分支,二者S蛋白序列的主要差别是BQ.1.1多了R346T位点突变。12月13日,据中国疾控中心通报,中国已在9个省份的本土病例中检出BQ.1及其亚分支49例,但尚未广泛流行。作为两个奥密克戎BA.2后代突变株的重组体的XBB,有极强的免疫逃逸能力,在出现后短短两周内就在新加坡成为主要流行株,印度也基本被XBB所占据。这些新变异株的崛起,主要“归功”于病毒刺突蛋白的受体结合域(RBD)发生突变,帮助新冠病毒逃逸新冠疫苗和自然感染诱导的中和性抗体。BQ.1.1有6个RBD突变,比BQ.1多了一个关键突变,而XBB的RBD突变有7个,似乎RBD突变越多,变异株的崛起速度越快。

BN.1是奥密克戎BA.2.75子变体的进化分支。BN.1是在2022年7月被科学家发现的,那时世界各国还没有出现1例感染,但仅仅3个多月的时间,该毒株已经传播到了36个国家。9月份传播至美国后,最新统计数据显示约占感染人群的3.8%。与BA.2.75子变体相比,BN.1的S蛋白序列增加了R346T、R356T、F490S三个突变。BM.1.1是BA.2.75的另一个进化分支,新增了R346T和F486S突变位点。

图3 新型变异株S蛋白序列突变位点的比较

北京大学曹云龙认为,作为我国人群主要的免疫背景,三针原始株灭活疫苗,特别是大多数人距离接种第三针已经过去半年以上,已经无法对部分最新的Omicron亚型产生较高的防感染作用,会导致我国绝大多数人群对此类新突变株易感。随着具备更强免疫逃逸能力的新毒株流行,再次感染的安全窗口可能会缩短。美国哥伦比亚大学何大一团队等于本月在Cell 期刊发表了题为:Alarming antibody evasion properties of rising SARS-CoV-2 BQ and XBB subvariants 的研究论文。该研究证实了BQ.1、BQ.1.1、XBB和XBB.1这些奥密克戎亚型具有目前已知最强的逃逸中和抗体的能力,因此,它们可能因为在逃逸中和抗体方面的优势而在人群中占据主导地位,成为新的主要流行株。

目前,我国疫情防控政策已经发生根本性变化,从“全面防控”转变为“重点防治”,呈现有序逐步开放。虽然我们还无法准确预测本轮感染高峰过后,下一个主流流行株是什么,但可以预见的是,病毒仍将朝着有利于自己更好生存的方向继续进化,由于免疫逃逸引发的重复感染概率将大大增加。未来的防疫将更多的依赖于疫苗和药物所构建的防治体系,加强对输入我国的和本土流行的Omicron变异株的基因组变异监测,对新出现的传播优势毒株,及时开展传播力、免疫逃逸能力和致病力评估,为疫苗研发和防控政策不断优化提供科学依据将是必由之路。

疫情当前,达瑞生物与中检院达成新冠假病毒中和抗体检测独家产业化合作,推出BF.7、BQ.1、BQ.1.1、XBB、XBB.1、BN.1、BM.1.1等多株新型Omicron变异株假病毒(见表1),助力新冠疫苗、药物以及相关基础性科学研究,可同步提供相关毒株的委托检测服务。

Omicron新型变异株及既往主要毒株假病毒产品列表

注:橙色背景为本次新增Omicron子变体假病毒产品。

标签: 中和抗体 突变位点 北京大学

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